В журнале European Journal of Human Genetics опубликована статья сотрудников ФГБНУ «МГНЦ»
В журнале European Journal of Human Genetics (IF - 3.636, Q2 квартиль) опубликована статья, выполненная совместно коллективами лабораторий функциональной геномики и генетической эпидемиологии ФГБНУ «МГНЦ»:
«Functional reassessment of PAX6 single nucleotide variants by in vitro splicing assay»
Alexandra Yu. Filatova, Tatiana A. Vasilyeva, Andrey V. Marakhonov, Anna A. Voskresenskaya, Rena A. Zinchenko & Mikhail Yu. Skoblov
Варианты нуклеотидной последовательности, нарушающие процесс прохождения сплайсинга пре-мРНК, могут являться причиной развития многих генетических заболеваний. Однако из-за сложности регуляции процесса сплайсинга трудно предсказать точное влияние конкретных нуклеотидных изменений на структуру мРНК. По этой причине многие вновь обнаруженные варианты ошибочно относят к группе с неизвестным клиническим значением (variant of uncertain significance, VUS). В настоящей работе авторы провели экспериментальный функциональный анализ 8 вариантов нуклеотидной последовательности гена PAX6, обнаруженных у пациентов с диагнозом врожденная аниридия (ВА). Было установлено, что 5 интронных, 1 миссенс и 1 синонимичный варианты изменяют нормальный паттерн сплайсинга пре-мРНК PAX6, что приводит к образованию преждевременного стоп-кодона с последующим разрушением аберрантной мРНК. Эти результаты позволили авторам переклассифицировать исследуемые варианты в варианты с потерей функции (loss-of-function) и доказать их патогенный статус. Впервые в случае ВА показана патогенная роль синонимичного варианта нуклеотидной последовательности.