Результаты широкогеномного анализа метилирования ДНК опухоли молочной железы опубликованы в журнале «ScientificReports»
В журнале «ScientificReports» (Q1, IF 3.998, ) опубликована статья сотрудников лаборатории эпигенетики ФГБНУ «МГНЦ» (зав. - д.б.н. Стрельников В.В.) - одна из первых работ такого рода в мире.
Предоперационная (неоадъювантная) химиотерапия (НАХТ) назначается для уменьшения объема опухоли и сокращения объема хирургического вмешательства. Однако в 30–60% случаев она не приносит ожидаемого эффекта, а методы прогнозирования ее эффективности пока недостаточно эффективны.
В лаборатории эпигенетики ФГБНУ «МГНЦ» провели широкогеномный анализ метилирования ДНК и отобрали CpG-динуклеотиды, различия в метилировании которых маркируют опухоли молочной железы с различной чувствительностью к НАХТ.
Первый вариант прогностической панели исследователи представили в 2017 году, он включал 12 генов. Однако главная ценность диагностики – высокая точность при относительно небольшом количестве биомаркеров. Новая панель включает всего два гена. Диагностическая точность классификатора на основе метилирования генов IRF4 и C1QL2 составляет 0,75, с чувствительностью 75% и специфичностью 75%.
Представленная работа – одна из первых такого рода в мире. Исследование поддержано грантом РНФ№18-15-430.
DNA methylation markers panel can improve prediction of response to neoadjuvant chemotherapy in luminal B breast cancer
Sigin, V. O., Kalinkin, A. I., Kuznetsova, E. B., Simonova, O. A., Chesnokova, G. G., Litviakov, N. V., Slonimskaya, E. M., Tsyganov, M. M., Ibragimova, M. K., Volodin, I. V., Vinogradov, I. I., Vinogradov, M. I., Vinogradov, I. Y., Kutsev, S. I., Strelnikov, V. V., Zaletaev, D. V., Tanas, A. S.
Scientific Reports volume 10, Article number: 9239 (2020);