Открыт новый молекулярно-генетический механизм патогенеза болезни Ниманна-Пика тип С

Сотрудники из лабораторий наследственных болезней обмена веществ и функциональной геномики ФГБНУ «МГНЦ» впервые описали редкий молекулярно-генетический механизм патогенеза болезни Ниманна-Пика тип С. Данный механизм заключается в совместном эффекте редкого и частого синонимичных вариантов в гене NPC1, который приводит к нарушению сплайсинга. Используя методику экспрессии минигена было показано, что лишь наличие обоих вариантов в цис-положении приводит к активации скрытого сайта сплайсинга в экзоне 18 гена NPC1, что приводит к укорочению экзона на уровне мРНК. Используя методы количественного анализа мРНК и методы гистохимии авторы также показали, что обнаруженный комплексный аллель c.[2727 C > T;2793 C > T] является гипоморфным и ассоциирован со взрослой формой болезни Ниманна-Пика тип С.

Данная работа обращает внимание исследователей на важность анализа «сырых» данных, полученных методами секвенирования нового поколения, т.к. полиморфные варианты, которые зачастую отфильтровываются на этапе обработки данных, могут оказывать прямое модифицирующее действие на обнаруженные редкие варианты. Пренебрежение данным фактом может привести к трудностям и разночтениям при постановке молекулярно-генетического диагноза или даже к ошибочному диагнозу.
Результаты работы опубликованы в журнале European Journal of Human Genetics (Q2, Impact Factor: 3.657)

Bychkov, I., Filatova, A., Perelman, G. et al. Additive effect of frequent polymorphism and rare synonymous variant alters splicing in twin patients with Niemann-Pick disease type C. Eur J Hum Genet (2021). https://doi.org/10.1038/s41431-021-00898-7 

https://www.nature.com/articles/s41431-021-00898-7