Михаил Юрьевич окончил химический факультет Московского государственного университета им. М.В.Ломоносова в 2000 году, кафедру химии природных соединений. Свою кандидатскую работу выполнял в Институте общей генетики им. Н.И.Вавилова РАН по теме «Структура и особенности регуляции генов гомологов RFP2 у человека и мыши», которую успешно защитил в 2004 году. С 2005 году М.Ю. Скоблов работает в Медико-генетическом научном центре.
М.Ю.Скоблов опубликовал 90 научных статей в отечественных и зарубежных журналах (h-индекс 16). Научные интересы: функциональный анализ генома человека, исследование функций новых генов, регуляция экспрессии генов, некодирующие РНК.