Лаборатория молекулярной генетики сложно наследуемых заболеваний

В лаборатории впервые среди российских больных изучены спектры и частоты мутаций в генах предрасположенности к социально-значимым онкологическим заболеваниям. Например, раку молочной железы и яичников, колоректальному раку, семейному аденоматозному полипозу, раку желудка, рак тела матки и др. На этой основе разработаны способы диагностики предрасположенности к раку многих локализаций, накоплен большой опыт практической диагностики.

Исследуется влияние функциональных особенностей генов и микроРНК на развитие раковой опухоли. Получены новые данные о связи экспрессии генов с прогрессией рака, характеристиками выживаемости и ответом на лекарственное воздействие. Разработаны способы, позволяющие индивидуализировать терапию рака и повысить эффективность лечения, снизить его токсичность.

Разработано новое лекарственное средство для терапии рака толстой кишки на наиболее современной основе – малых интерферирующих РНК. Проведенные доклинические исследования продемонстрировали его высокую эффективность и низкие токсичность, иммуногенность и мутагенность.

Докторские диссертации:

1. Поспехова Н.И. Комплексный анализ наследственной формы рака молочной железы и/или яичников: Молекулярно-генетические и фенотипические характеристики. Диссертация на соискание учёной степени доктора биологических наук, 2010 г.

Кандидатские диссертации:

1. Н.В. Апанович. «Экспрессионные профили потенциальных генов-маркеров при светлоклеточном почечно-клеточном раке». Диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук, 2018 г.
2. Ворошилова Е. А. Молекулярно-генетические нарушения и их прогностическое значение при метастатическом почечноклеточном раке. Диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук, 2015 г.
3. Коротаева А. А. Разработка мишеней для терапии колоректального рака на основе функциональной геномики. Диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук, 2013 г.
4. Шубин В.П. Молекулярно-генетический анализ особенностей структуры и экспрессии генов BRCA1/2 при раке яичников и молочной железы. Диссертация на соискание учёной степени кандидата биологических наук, 2011 г
5. Цуканов А.С. Молекулярно – генетическое исследование наследственной предрасположенности к раку желудка. Диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук, 2008 г.
6. Смирнова Т.Ю. Молекулярно – генетическое исследование наследственной предрасположенности к раку яичников. Диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук, 2008 г.
7. Музаффарова Т.А. Молекулярно-генетические особенности семейного аденоматозного полипоза. Диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук, 2005 г.
8. Логинова А.Н. Молекулярно-генетический анализ наследственной формы рака      молочной железы и/или яичников. Диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук, 2004 г.
9. Салимов А.Г. Пространственное расположение локусов некоторых хромосом в ядрах лимфоцитов человека в норме и при воздействии, индуцирующем антимутагенную реакцию клеток (адаптивный ответ). Диссертация на соискание учёной степени кандидата биологических наук, 2003 г.

Избранные публикации:

1. N. V. Apanovich, M. V. Peters, P. V. Apanovich, B. Sh. Kamolov, Corresponding Member of the RAS V. B. Matveev, Academician E. K. Ginter, and A. V. Karpukhin. Expression Profiles of Genes—Potential Therapy Targets—and Their Relationship to Survival in Renal Cell Carcinoma. Doklady Biochemistry and Biophysics, 2018, Vol. 478, pp. 14–17.
2. Кипкеева Ф.М., Музаффарова Т.А., Никулин М.П., Апанович П.В., Карпухин А.В. Перспективные гены-мишени таргетной терапии и прогностические биомаркеры рака желудка. Вестник Российской академии медицинских наук. 2018;73(4):262-272.
3. Н.В.Апанович, М.В.Петерс, П.В.Апанович, А.С.Маркова, Б.Ш.Камолов, В.Б.Матвеев, А.В.Карпухин. Связь экспрессии генов–мишеней таргетной терапии с метастазированием светлоклеточного почечно-клеточного рака. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2018. Т.166. №8. С. 218-220.
4. Гришина К.А., Хайленко В.А., Хайленко Д.В., Карпухин А.В. Роль микроРНК в развитии рака молочной железы и их потенциал в качестве биомаркеров этого заболевания. Опухоли женской репродуктивной системы. 2018. Т.15. №3. С. 40–47.
5. Музаффарова Т.А., Мансорунов Д.Ж., Кипкеева Ф.М., Алимов А.А., Карпухин А.В. Редкий случай семейного аденоматозного полипоза толстой кишки. Медицинская генетика. 2018. №6. С.48-51.
6. Н.В. Апанович, А.В. Карпухин. Преимущества и ограничения метода петлевой амплификации. Онкоурология. 2018. Т. 14. №2. С. 100 – 101.
7. Ф.М. Кипкеева, Т.А. Музуффарова, М.Н. Нариманов, О.А. Малехова, Т.А. Богуш, А.В. Карпухин. Профили экспрессии потенциальных генов- мишеней при диссеминированном раке желудка. Российский биотерапевтический журнал. 2017. Т. 16. С. 24-27.
8. А.Ю. Кузеванова, А.С. Лунева, М.А. Маслов, А.В. Карпухин, А.А. Алимов. Распределение таргетных малых интерферирующих РНК после внутривенного введения. Вестник РГМУ. 2017. № 3. С. 32 – 36.
9. И. В. Пронина, Е. А. Климов, А. М. Бурденный, Е. В. Береснева, М. В. Фридман, В. Д. Ермилова, Т. П. Казубская, А. В. Карпухин, Э. А. Брага, В. И. Логинов. Метилирование генов микроРНК miR-129-2, miR-9-1, изменение их экспрессии и активация генов потенциальных мишеней этих микроРНК при раке почки. Молекулярная биология, 2017, том 51, № 1, с. 73–84.
10. В. И. Логинов, Е. В. Береснева, Т. П. Казубская, Э. А. Брага, А. В. Карпухин.   Метилирование 10 генов микроРНК при светлоклеточном раке почки и их диагностическое значение. Онкоурология. 2017. Т. 13. №3. С. 30 – 36.
11. Береснева Е.В., Логинов В.И., Ходырев Д.С., Пронина И.В., Казубская Т.П., Карпухин А.В., Брага Э.А., Кушлинский Н.Е. Гиперметилированные гены микроРНК как потенциальные маркеры светлоклеточного рака почки.  Клиническая лабораторная диагностика. 2017. Т. 62. № 1. С. 13-18.  
12. К.А. Гришина, Т.А. Музаффарова, В.А. Хайленко, А.В. Карпухин. Молекулярно-генетические маркёры рака молочной железы. Опухоли женской репродуктивной системы. 2016. Т.12. № 3. C. 36-42.
13. Н.В. Апанович, М.В. Петерс, А. А. Коротаева, П.В. Апанович, А. С. Маркова, Б.Ш. Камолов, В.Б. Матвеев, А.В. Карпухин. Молекулярно-генетическая диагностика светлоклеточного почечно-клеточного рака. Онкоурология. 2016. Т.12. № 4. С.14-18.
14. Коротаева А.А., Карпухин А.В. Гены ингибиторов апоптоза в качестве мишеней противораковой терапии и прогностических маркеров. Молекулярная медицина. 2015. № 6. С. 9-14.
15. Е.А. Ворошилова, Н.В. Апанович, Д.А. Носов, А.В. Карпухин, И.Н. Соколова, М.Ю. Федянин. Факторы прогноза эффективности терапии ингибиторами mTOR и ингибиторами VEGFR у больных метастатическим почечноклеточным раком. Онкоурология. 2015. №4. С. 13-20.
16. Н.В. Апанович, П.В. Апанович, А.В. Карпухин. Молекулярно – генетические характеристики и маркеры почечно-клеточной карциномы. Медицинская генетика. 2014. № 9. С. 3-10.
17. Пронина И. В, Климов Е. А., Бурденный А. М., Береснева Е. В., Фридман М. В., Ермилова В. Д., Казубская Т. П., Карпухин А.В., Брага Э. А., Логинов В. И. Дерегуляция экспрессии генов miR-129-2, mi R-9-1, и группы их потенциальных мишеней, генов хромосомы 3, при светлоклеточном раке почки. Молекулярная биология . 2016. №2.
18. Loginov V.I., Dmitriev A.A., Senchenko V.N., Pronina .IV., Khodyrev D.S., Kudryavtseva A.V., Krasnov G.S., Gerashchenko G.V., Chashchina L.I., Kasubskaya T.P., Kondratieva T.T., Lerman M.I., Angeloni D., Braga E.A., Kashuba V.I. Tumor suppressor function of the SEMA3B gene in human lung and renal cancers: influence on cancer progression and angiogenesis. Plos One, 2015, 10(5):e0123369.
19. А.S. Bavykin, A. A. Korotaeva, A.V. Syrtsev, S.V. Poyarkov, S.A. Tuljandin, A.V. Karpukhin. Double siRNA-targeting of cIAP2 and Livin results in synergetic sensitization of HCT-116 cells to oxaliplatin treatment. OncoTargets and Therapy. 2013. V.6. Р.1333-1340.
20. А.С. Цуканов, Ю.А. Шелыгин, В.Н. Кашников, С.А. Фролов, Л.Н. Любченко, В.П. Шубин, А.В. Карпухин, Т.А. Музаффарова, Н.И. Поспехова. Молекулярно-генетическое исследование наследственной предрасположенности к диффузному раку желудка у российских пациентов. Вопросы онкологии. 2013. Т.59. №5. С.580-584.
21. Н.И. Поспехова, С.В. Поярков, В.П. Шубин, Е.В. Каткова, В.А. Хайленко, А.В. Карпухин.   Экспрессионный анализ микроРНК для диагностики и прогноза рака молочной железы. Журнал «Злокачественные опухоли» (Journal of Malignant Tumours). 2012. Т.2. №2. С.91-98.
22. Коротаева А.А., Бавыкин А.С., Поярков С.В., Карпухин А.В. Ингибирование потенциальных генов мишеней с помощью интерферирующих РНК в клетках колоректального рака. Интеграл. 2012. №5(67), 26-28.
23. А.С. Бавыкин, А.А. Коротаева, А.В. Сырцев, А.В. Карпухин. Разработка способов повышения эффективности химиотерапии на основе малых интерферирующих РНК. Журнал «Злокачественные опухоли» (Journal of Malignant Tumours). 2012. Т.2. №2. С.111-116.
24. Бавыкин А.С., Мишин Д.В.,  Карпухин А.В.,  Дерябин П.Г. Способность малых интерферирующих РНК – олигонуклеотидов снижать инфекционную активность вируса гепатита С в культурах клеток. Вопросы вирусологии. 2012. Т. 57. №2. С.32-34.
25. Львов Н. Д., Бавыкин А. С., Мельниченко А. В., Карпухин А. В. Блокирование функций гена RSI вируса простого герпеса 2-го типа (ВПГ-2) малыми интерферирующими РНК - новые перспективы для направленного противовирусного воздействия. - Вопросы Вирусологии, 2012. Т57, №3 , С.14-16.
26. Апанович Н.В., Шубин В.П., Коротаева А.А., Бавыкин А.С., Ким Е.А., Закиряходжаев А.Д., Летягин В.П., Высоцкая И.В., Карпухин А.В. Современные молекулярно-генетические маркеры рака молочной железы // Опухоли женской репродуктивной системы. – 2011. - №1. – С.19-28.
27. Шубин В.П., Карпухин А.В. Молекулярная генетика наследственной предрасположенности к раку яичников // Медицинская генетика. – 2011. – Т.10. - №4. – с.39-47.
28. М.В. Петерс, Апанович Н.В., В.Б. Матвеев, А.В. Карпухин. Анализ экспрессии генов – потенциальных мишеней при системной терапии рака почки. Онкоурология. 2011. №3. С.59-64.
29. А.М.Кузьминов, А.В.Карпухин, И.Ю.Сачков, Ю.Ю.Чубаров, Савельева Т.А. «Клинико-генетические характеристики и лечебная тактика при ослабленной форме семейного аденоматоза толстой кишки». Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии и колопроктологии, 2011 г., №3, т.21. стр. 78-85.
30. Шубин В.П. , Логинова А.Н. , Поспехова Н.И. , Волкова О.В. , Мельцаев Г.Г. , Карпухин А.В. Наследственный рак яичников: молекулярно-генетические характеристики и популяционные особенности // Справочник акушера-гинеколога. – 2011. - №5. – С.53-58.
31. А.А. Коротаева, Т.А. Музаффарова, И.Ю. Сачков, А.М. Кузьминов, А.В. Карпухин.         Мутации в генах MYH и АРС при множественном полипозе среди российских больных.   Медицинская генетика. 2011. №1. С. 14-18.
32. В.П. Шубин, А.Н. Логинова, Н.И. Поспехова, О.В. Волкова, Г.Г. Мельцаев, А.В. Карпухин. Особенности спектра и частота мутаций в гене BRCA1 при раке яичников в Республике Мордовия. Медицинская генетика. 2011. №1. С. 19-24.
33. Никонова Т.В., Апанович П.В., Пекарева Е.В., Горелышева В.А., Степанова С.М., Тишина Ю.В., Прокофьев С.А., Карпухин А.В. Иммуногенетические аспекты медленно прогрессирующего аутоиммунного диабета у взрослых (LADA). Сахарный диабет. 2011. № 1. С. 28-33.
34. Н.И. Поспехова, А.Н. Логинова, В.П. Шубин, С.М. Портной, А.А. Лушникова, О.А. Анурова, Л.Н. Любченко, А.В. Карпухин. Двухсторонний рак молочной железы в российской популяции: молекулярно-генетические, семейные и клинические характеристики. Молекулярная медицина. 2010. № 3. С. 38-42.
35. Кузьминов А.М., Карпухин А.В., Сачков И.Ю., Чубаров Ю.Ю., Савельева Т.А. Клинико-генетические взаимодействия и их роль в определении лечебной тактики при семейном аденоматозе толстой кишки. Колопроктология. 2010. №1. С.24-30.
36. В.П. Шубин, А.Н. Логинова, Н.И. Поспехова, О.В. Волкова, Г.Г. Мельцаев, А.В. Карпухин. Особенности спектра и частота мутаций в гене BRCA1 при раке яичников в Республике Мордовия. Медицинская генетика. 2011. №1. С. 19-24.
37. Н.В. Апанович1, Н.И. Поспехова1, А.Н. Логинова1, Л.Н. Любченко2, П.В. Апанович1, Р.Ф. Гарькавцева2, Е.К. Гинтер1, А.В. Карпухин1 Определение протяженных делеций в гене BRCA1 при семейной форме рака молочной железы/яичников среди российских больных. Медицинская генетика. 2009. №9. С.25-31.
38. Перевезенцев, О. А. Карпухин, А.В. Мамедов, И.С., Ситников, В.Ф. Молекулярно-генетические факторы артериальной гипертензии у детей// Российский вестник перинатологии и педиатрии. - 2009. - N 1. - С. 18-27.
39. Е.Л. Корчагина, Н.Ф. Белев, Т.П. Казубская, Ю.А. Барсуков, Ю.М. Тимофеев, Т.А. Музаффарова, А.В. Карпухин, Р.Ф. Гарькавцева. Клинико-генетические аспекты рака толстой кишки и идентификация его наследственных форм. Колопроктология. 2008, №2, С.19-24.
40. А.А. Коротаева, Т.А. Музаффарова, А.В. Карпухин. Молекулярно-генетические причины множественного полипоза и рака толстой кишки: наследственные мутации в гене MYH. Медицинская генетика. 2008, №9, С.10-17.
41. Л.Н. Любченко, Р.Ф. Гарькавцева, Н.И. Поспехова., A.В. Карпухин. Медико-генетическое консультирование при наследственном раке молочной железы. Медицинская генетика. 2008, № 10, С.30-34.
42. А.С. Цуканов, Н.И. Поспехова, Л.Н. Любченко, С.Ф. Захаров, Е.А. Гончарова, М.П. Никулин, Р.Ф. Гарькавцева, Е.К. Гинтер, А.В. Карпухин. Молекулярно-генетический анализ генов наследственной предрасположенности к раку желудка // Медицинская генетика. 2007, №12, С. 30-34.
43. Смирнова Т.Ю. 1, Любченко Л.Н. 2, Поспехова Н.И. 1, Гарькавцева Р.Ф. 2, Карпухин А.В. 1 Наследственные факторы в заболеваниях репродуктивной системы женщин: рак молочной железы и яичников. Опухоли женской репродуктивной системы: маммология, онкогинекология. 2007, №4, С. 90-96
44. Т.Ю. Смирнова, Н.И. Поспехова, Л.Н. Любченко, Л.И. Османова, С.А. Тюляндин, Р.Ф. Гарькавцева, Е.К. Гинтер, А.В. Карпухин. Высокая частота мутаций в генах BRCA1 и BRCA2 при раке яичников. .// Бюлл. эксп. биол. и мед. 2007, № 7, С. 93-95.
45. Карпухин А.В.1, Поспехова Н.И.1, Музаффарова Т.А.1 и др. Молекулярная диагностика моногенных форм рака// Медицинская генетика. 2006. т.5, прил.2. С. 1-6.
46. Музаффарова Т.А., Поспехова Н.И, Сачков И.Ю., Кузьминов А.М., Гинтер Е.К., Карпухин А.В. Новые мутации в гене АРС при семейном аденоматозном полипозе: обнаружение, характеристика и анализ// Бюллетень эксп. биол. и мед. – 2005. – Т.139, № 3. – С. 334-336.
47. А.Н. Логинова, Н.И. Поспехова, Л.Н. Любченко, А.В. Будилов, В.М. Захарьев, Р.Ф. Гарькавцева, Е.К. Гинтер, А.В. Карпухин. Спектр мутаций в гене BRCA1 при наследственной предрасположенности к раку молочной железы и яичников в российских семьях.// Бюлл. эксп. биол. и мед. – 2003. Т.136, №9, С. 315-317.
48. Карпухин А.В., Поспехова Н.И., Любченко Л.Н., и др. Частоты однонуклеотидных полиморфизмов и мутаций в гене BRCA1 при наследственно обусловленном раке молочной железы и яичников// Докл. АН.-2002.- Т.383.- № 5.- С. 706-709.