В МГНЦ разработали метод косвенной диагностики хроматинопатий на примере синдрома Рубинштейна-Тейби 1

Хроматинопатии – группа заболеваний, включающая 179 синдромов, причиной развития которых становятся патогенные варианты в генах эпигенетической регуляции. Эти синдромные расстройства имеют общие клинические проявления, включая умственную отсталость, нарушения роста и врожденные аномалии.

В числе хроматинопатий – синдром Рубинштейна-Тейби, заболевание с аутосомно-доминантным типом наследования. Его причина – патогенные варианты в генах CREBBP, EP300. Молекулярно-генетическое тестирование синдрома включает несколько этапов, однако, значительное число пациентов с характерными клиническими признаками остаются недиагностированными. Например, исследование генов CREBBP и EP300 в одной из крупнейших когорт, включавшей 395 пробандов, позволило установить диагноз только в 37% случаев. Проблема недостаточной эффективности молекулярных методов характерна для всех хроматинопатий, поэтому вопрос оптимизации диагностических алгоритмов является актуальным. Определение эписингнатур – одно из наиболее активно развивающихся направлений диагностики.

Специалисты лаборатории эпигенетики Медико-генетического научного центра имени академика Н.П. Бочкова разработали уникальный метод косвенной диагностики хроматинопатий на примере синдрома Рубинштейна-Тейби 1. Метод основан на бисульфитном секвенировании нового поколения (NGS) и бисульфитном секвенировании по Сэнгеру ограниченного набора локусов, воспроизводящих классическую эписигнатуру синдрома. Статья опубликована в журнале «Inrernational Journal of molecular science» (Q1).

Исследователи показали, что эписигнатуру синдрома Рубинштейна–Тейби 1 можно редуцировать до одного локуса генома человека с наиболее значимыми изменениями уровня метилирования. Количественный анализ уровня метилирования ДНК этого локуса позволяет точно идентифицировать пациентов с синдромом Рубинштейна-Тейби 1.

Методы диагностики доступны и могут быть интегрированы в клиническую практику.

Авторы: О.А. Земляная, А.И. Калинкин, А.С. Танас, А.В. Ефремова, И.В. Володин, О.Р. Исмагилова, А.С. Смирнов, Д.В. Залетаев, М.В. Немцова, С.И. Куцев, В.В. Стрельников