В МГНЦ представили метод диагностики мозаичных форм синдрома избыточного роста

Статья, посвященная методу, вышла в журнале «Медицинская генетика».

Метод основан на удалении аллеля дикого типа с помощью ферментативного гидролиза дуплекс-специфической нуклеазой (ДСН) и последующего секвенирования по Сэнгеру. Он позволяет генотипировать вариант с низкой представленностью практически в любой точке генома и подходит, как для использования в качестве первой линии диагностики, так и в качестве валидирующего метода.

Метод использовался для генотипирования 9 пациентов с клиническими признаками синдрома избыточного роста (PROS), у которых ранее на NGS-панели с глубоким покрытием были выявлены полиморфные варианты в гене PIK3CA. Уровень представленности альтернативного аллеля у пациентов составлял от 17% до 4%. Для определения аналитических свойств метода моделировали уровень представленности альтернативного аллеля, в качестве материала использовали образцы ДНК из лейкоцитов периферической крови, гомозиготных по референсному и полиморфному вариантам. Для генотипирования пациентов отбирали свежезамороженный биоптат из очага патологического разрастания тканей.

Кроме того, авторы впервые разработали системы ДНК-зондов для ферментативного гидролиза ДСН для однонуклеотидных вариантов PIK3CA. Разработанный диагностический подход прост в применении, точен и может рассматриваться для использования в клинико-лабораторной диагностике.

Работа специалистов лаборатории эпигенетики ожирения и диабета над методом диагностики мозаичных форм синдрома избыточного роста позволила расширить возможности существующих инструментов для решения научных и клинических задач.

Авторы: Пустовалова А.В., Николаева А.Ф., Петрова К.О., Бычкова Е.В., Сигин В.О., Стрельников В.В.