Сотрудники МГНЦ опубликовали обзор методов идентификации сайтов встраивания интегрирующихся вирусов
Сегодня одно из важнейших направлений в развитии современного здравоохранения –персонализированная медицина. В разработке ее методов ключевую роль играют рекомбинантные вирусные векторы, которые обеспечивают эффективную доставку генетических конструкций в клетки. Рекомбинантные вирусные векторы – это ценный инструмент для доставки генетических конструкций в клетки многоклеточных организмов и для проникновения в клетку-хозяина.
Но при этом есть определенные риски. Так, ретровирусные, включая лентивирусные, векторы способны обеспечивать длительную экспрессию за счёт интеграции в геном хозяина. Эта интеграция, хотя и следует определённым вирус-специфическим паттернам, остаётся стохастическим процессом и сопряжена с риском инсерционного мутагенеза, включая активацию онкогенов, рассказала заведующая лабораторией редактирования генома Медико-генетического научного центра имени академика Н.П. Бочкова, к.м.н., доцент Светлана Смирнихина.
По ее словам, подробное картирование локусов интеграции вирусных векторов имеет критическое значение для оценки их безопасности в доклинических и клинических исследованиях.
Специалисты лаборатории редактирования генома МГНЦ посвятили свою научную работу развитию подходов к выявлению локусов интеграции ретровирусов и ретровирусных, в том числе, лентивирусных векторов, а также сравнению их ключевых особенностей, преимуществ и ограничений. Результаты ученые изложили в обзорной статье, которая опубликована в журнале «Frontiers in Bioengineering and Biotechnology» (Q1, импакт-фактор 4,8).
«В статье рассматривается развитие методов анализа сайтов интеграции – от ранних трудоёмких подходов с ограниченным охватом до современных высокопроизводительных методик. Освещены ключевые технологии – inverse PCR (iPCR), ligation-mediated PCR (LM-PCR), linear amplification-mediated PCR (LAM-PCR) – их преимущества, ограничения и вклад в формирование современной практики интеграционного анализа», – пояснила Светлана Смирнихина.
Отдельное внимание генетики уделили современным подходам, связанным с рестрикционной обработкой или ПЦР. По мнению авторов исследования, эти подходы свободны от искажений и позволяют получать более точное и непредвзятое представление о профиле интеграции. Несмотря на появление новых методов, классические технологии, в частности, LAM-PCR и её модификации (nrLAM-PCR), продолжают сохранять статус стандарта в исследовательских и прикладных платформах, уверены эксперты МГНЦ.
«Точные методы определения сайтов интеграции (ISA) по-прежнему имеют решающее значение для оценки безопасности применения вирусных векторов и понимания закономерностей интеграции, то есть изучения клональной динамики трансдуцированных клеток. Современные методы ISA позволяют систематически выявлять такие события, уточнять паттерны интеграции и оценивать клональную динамику модифицированных клеток in vivo, тем самым, предоставляя критически важные данные для доклинических и клинических исследований», – резюмировала Светлана Смирнихина.
Kochergin-Nikitsky K., Lavrov A., Smirnikhina S. Methodological Landscape of Retroviral and Retroviral Vector Integration Site Identification. Frontiers in Bioengineering and Biotechnology. 2025. 13:1708724. doi:10.3389/fbioe.2025.1708724
Подробно ознакомиться со статьей можно по ссылке: https://www.frontiersin.org/journals/bioengineering-and-biotechnology/articles/10.3389/fbioe.2025.1708724