Крайне редкие случаи сочетания наследственных болезней были выявлены в ходе совместной работы МГНЦ и «Биотехнологического кампуса»

Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова выступил одним из ключевых медицинских партнеров Национальной генетической инициативы «100 000 + Я».

Национальную генетическую инициативу «100 000 + Я» реализует «Биотехнологический кампус» в рамках федеральной научно-технической программы развития генетических технологий, технологическим партнером которой является ПАО «НК «Роснефть».

«У нас более двадцати партнерских организаций, которые на протяжении почти трех лет предоставляли нам образцы пациентов. В ходе работы мы с коллегами концентрировались, прежде всего, на орфанных генетических заболеваниях, иммунодефицитах, некоторых болезнях крови и наследственных онкологических заболеваниях. Это был осознанный выбор, так как именно для этих патологий использование полногеномных данных позволяет помочь пациентам практически в реальном времени. Наш центр специализируется на полногеномном секвенировании. Наличие полного генома позволяет выявить патогенные варианты, которые не могут быть выявлены при исследованиях меньшего объема, таких как секвенирование отдельных генов, панельные секвенирования нескольких генов интересов, или экзомное секвенирования генов, кодирующих белки. С другой стороны, все информация, которая может быть выявлена названными методами содержится в данных полногеномного секвенирования. Совместно с партнерами нами были проведены работы, в результате которых удалось доказать, что полногеномное секвенирование обладает необходимой точностью и может достоверно выявлять генетические варианты, ответственные за заболевания. С другой стороны, так как результаты полногеномного секвенирования очень объемны, их анализ и хранение требует специальной инфраструктуры. В случае с МГНЦ эти проблемы были решены, что позволило в полной мере воспользоваться преимуществами полногеномного секвенирования и дало возможность выйти на молекулярные диагнозы, которые не могли быть поставлены с помощью других технологий. Это в, свою очередь, оказало реальное влияние на судьбы пациентов», - отметил генеральный директор «Биотехнологический кампус», научный руководитель Национальной генетической инициативы «100 000 + Я», д.б.н., профессор Константин Северинов.

Несмотря на то, что генетические заболевания относятся к редким, в практике врачей-генетиков могут встречаться еще более редкие случаи сочетания двух и более болезней. Для большинства орфанных заболеваний характерна проблема долгого диагностического поиска или «орфанной одиссеи». Для особо редких случаев сочетания наследственных болезней такая проблема стоит особенно остро.

«Симптомы двух заболеваний смешиваются, создавая уникальную запутанную клиническую картину, то есть симптомы одной болезни могут маскировать, перекрывать или видоизменять симптомы другой, картина заболевания становится атипичной и не соответствует классическим описаниям. Врач видит сложное сочетание клинических проявлений и пытается найти одну причину, которая бы все объяснила, но ее просто не существует. В некоторых случаях диагноз второй болезни остается «под прикрытием» первого, т.е. часто после долгих поисков находят одну генетическую патологию, ставят диагноз и на этом останавливаются. Но если у пациента есть вторая, невыявленная болезнь, часть симптомов остается без объяснения и лечения. Меняется ли ситуация? Да, кардинально, мы стали диагностировать такие сочетания редких болезней у одного пациента намного чаще, и это прямое следствие внедрения полногеномных технологий в повседневную практику врачей-генетиков, то есть, благодаря полногеномному секвенированию мы теперь можем одновременно анализировать все гены и распутывать клубок разнородных симптомов у пациента. Раньше такие пациенты годами оставались без диагноза, все списывалось на «уникальный сложный случай». Сегодня мы видим, что частота двойных и тройных диагнозов достигает 1-5% среди тех, кто проходит углубленное генетическое тестирование. Таким образом, современные методы полногеномного секвенирования не просто улучшили диагностику, они позволили обнаружить множество сложных клинических случаев с двумя и более заболеваниями и дать пациентам шанс на правильное лечение», - рассказала заведующая Научно-консультативным отделом МГНЦ, д.м.н., Татьяна Маркова.

Совместная работа Медико-генетического научного центра имени академика Н.П. Бочкова и «Биотехнологического кампуса» в рамках Национальной генетической инициативы «100 000 + Я» позволила в короткие сроки установить редкие диагнозы сочетания наследственных заболеваний.

К специалистам МГНЦ обратились родители 17-летней девочки с характерными чертами редкого синдрома Робинова. Однако у нее также наблюдались задержка развития и судороги, что нетипично для этого синдрома. Полногеномное секвенирование выявило не только ожидаемый патогенный вариант в гене WNT5A, ответственный за этот синдром, но и делецию хромосомы 22, соответствующую синдрому Фелан-Макдермид. Это полностью объяснило неврологические симптомы и изменило тактику ведения пациента.

«Когда мы начали применять полногеномный анализ, перед нами открылась сложная мозаика сочетаний разных наследственных заболеваний. В другом, более сложном случае, у девочки с раннего детства была диагностирована наследственная тугоухость, подтвержденная генетическим тестированием. Однако после успешной кохлеарной имплантации развитие речи оставалось замедленным, что насторожило генетиков. Повторный анализ методом полногеномного секвенирования выявил не только патогенные варианты в гене тугоухости TMC1, но и вторую, ранее невыявленную патологию - делецию в гене SETD1A, связанную с крайне редким синдромом задержки развития и риском возникновения судорог и эпилепсии. Это новый синдром, он описан всего у 15 пациентов в мире. Это объяснило весь спектр симптомов и определило дальнейшую тактику наблюдения ребенка. Хочется отметить, что список таких случаев растет ежедневно. Без современных технологий эти пациенты оставались бы без полного диагноза и адекватного лечения. Каждый такой случай уникален и требует персонализированного подхода», - отметила заведующая Научно-консультативным отделом МГНЦ, д.м.н. Татьяна Маркова.

«В ситуациях, когда врач сталкивается с «неклассической» клинической картиной или подозревает ультраредкое заболевание, секвенирование полного генома становится настоящим спасением. В таких случаях практически невозможно предположить, в каком именно гене или группе генов следует искать причину. Это особенно актуально, поскольку случаи двух и даже трех независимых наследственных заболеваний у одного пациента в современной практике перестали быть редкостью. С другой стороны, современная молекулярная диагностика требует одновременного выявления разнородных повреждений: однонуклеотидных замен, небольших вставок и делеций, масштабных хромосомных перестроек, а также вариантов в некодирующих областях генома — регуляторных участках и других функциональных элементах. Полногеномное секвенирование решает обе эти проблемы. Оно не только разрешает сложные диагностические головоломки, но и зачастую становится единственным методом, позволяющим избежать многолетней «диагностической одиссеи» и получить целостное представление о причинах развития всего спектра симптомов заболевания», - резюмировала начальник информационно-аналитического отдела, заведующая лабораторией молекулярно-генетической диагностики №3 Медико-генетического научного центра имени академика Н.П. Бочкова, врач-лабораторный генетик, к.м.н. Оксана Рыжкова.