Делегация ученых МГНЦ приняла участие в Европейской конференции по генетике человека в Милане (ESHG-2025)

Конференция Европейского общества генетиков человека (ESHG-2025) прошла 24-27 мая в Милане. Мероприятие является одним из самых значимых событий в мире медицинской генетики.

Научные сотрудники Медико-генетического научного центра имени академика Н.П. Бочкова подготовили около 50 постерных докладов. Центр представили следующие научно-исследовательские подразделения:

Лаборатория ДНК-диагностики
Лаборатория молекулярно-генетической диагностики №1
Лаборатория молекулярно-генетической диагностики №3
Лаборатория наследственных нарушений иммунитета
Лаборатория редактирования генома
Лаборатория функционального анализа
Лаборатория некодирующих вариантов генома
Лаборатория экспериментальной генной терапии болезней обмена веществ
Лаборатория нейрогенетики
Лаборатория эпигенетики
Лаборатория эпигенетики ожирения и диабета
Научно-консультативный отдел
Центр коллективного пользования «Геном»
Научно-клинический отдел муковисцидоза

Постерные сообщения сотрудников лабораторий ДНК-диагностики и молекулярно-генетической диагностики №1 были посвящены результатам полногеномного секвенирования российских пациентов с подозрением на наследственные заболевания сетчатки, исследованию вклада однородительской дисомии в патогенез заболеваний с аутосомно-рецессивным типом наследования, а также поиску причин мышечной дистрофии Дюшенна/Беккера у российских пациентов без молекулярного диагноза с использованием полногеномного секвенирования.

Научные сотрудники ЦКП «Геном» и лаборатории молекулярно-генетической диагностики №3 презентовали постерные доклады, посвященные клиническому применению секвенирования всего генома в российской когорте на примере 3600 геномов, паттернам инактивации Х-хромосомы и клиническим проявлениям у женщин с мутациями в гене EDA; выявлению новой делеции в гене COL9А3 у российских пациентов с множественной эпифизарной дисплазией, спектру редких вариантов при синдроме Нунан, генетическому ландшафту синдрома Кабуки, новому гомозиготному варианту сайта сплайсинга в гене WDR4, приводящему к редкому синдрому микроцефалии и др.

Ученые лаборатории редактирования генома остановились на вопросах клинической гетерогенности GBE1-ассоциированного состояния, оптимизации PegRNA для коррекции мутации F508del и восстановлению рамки считывания в гене DMD с помощью метода CRISPR.

Лаборатория эпигенетики ожирения и диабета представила постерный доклад, посвященный вариантам в гене LEPR, связанным с тяжелым ранним ожирением и гиперфагией.

Сотрудники научно-клинического отдела поделились с участниками конференции результатами работ, посвященных патологии скелета, наследственным болезням печени, детальному изучению генов SLC34A1 и SLC34A3, изменения в которых приводят к развитию тубулопатии.

Сотрудники лаборатории наследственных нарушений иммунитета совместно с коллегами НМИЦ ДГОИ имени Дмитрия Рогачева Минздрава России представили постерный доклад, посвященный группе пациентов с низкими показателями KREC, которые были выявлены в ходе проведения расширенного неонатального скрининга.

Лаборатория нейрогенетики представила данные по клиническим характеристикам и вариантам нуклеотидной последовательности групп пациентов с MORC2-ассоциированным состоянием. Выявлена взаимосвязь клинической картины синдрома DIGFAN и отдельных вариантов гена MORC2. Ученые лаборатории презентовали разработанный новый подход для выявления процессированных псевдогенов в данных полногеномного секвенирования, позволяющий обнаруживать события, ускользающие при стандартном анализе. Такая инновация помогла идентифицировать и охарактеризовать 48 новых событий.

Ученые лаборатории эпигенетики представили данные, посвященные мозаичным формам синдрома Хиппеля-Линдау, генетической гетерогенности в спектре избыточного роста (PROS), связанной с геном PIK3CA, а также новые данные по синдромам Рубинштейна-Тейби и Сотоса.

От отдела функциональной геномики было представлено 8 стендовых докладов. Ученые затронули вопросы функционального и клинического значения вариантов сплайсинга при несовершенном остеогенезе, а также у пациентов с фенотипами, ассоциированными с геном NBAS. Специалисты рассказали об исследовании вариантов сплайсинга в гене FBN1 с синдромом Марфана, комплексной молекулярной характеристике восьми семей с лице-плече-лопаточной мышечной дистрофией Ландузи-Дежерина, представили новые данные о вариантах uORF NF1 и NF2 и их роли в развитии нейрофиброматоза.

Кроме того, темами докладов стали различные исследования, которые проводили специалисты отдела функциональной геномики, в частности, клинический и молекулярный спектр нейродегенерации с накоплением железа в мозге в крупнейшей национальной когорте, а также расширенный взгляд на варианты uORF как причины менделевских нарушений.

Отзывы ученых МГНЦ о мероприятии

Я, Валерия Ковальская, научный сотрудник ЦКП «Геном», принимала участие в международной конференции ESHG 2025 в г. Милан (Италия) с 24 по 27 мая. Презентовала постерный доклад на тему «X-chromosome inactivation patterns and clinical manifestations in Russian females with EDA mutations». В рамках постерных докладов удалось обменяться контактами с итальянскими коллегами, которые изучают влияние сплайс-мутаций в гене EDA для потенциального сотрудничества. Самыми интересными для меня были доклады, посвященные RNA-seq, анализу данных long-read геномов, и, конечно, внутриутробному лечению Х-сцепленной эктодермальной дисплазиии.

Я, Мария Орлова, научный сотрудник ЦКП «Геном» и врач-лабораторный генетик ЛМГД3, принимала участие в международной конференции ESHG 2025 в г. Милан (Италия) с 24 по 27 мая. Презентовала постерный доклад на тему «Identification of novel recurrent gross deletion in COL9A3 gene in Russian patients with multiple epiphyseal dysplasia». Во время презентации моего постерного доклада мне удалось пообщаться с коллегами из Франции и Канады и обменяться опытом об особенностях диагностики множественной эпифизарной дисплазии и другой скелетной патологии. Самыми интересными для меня были секции по дизморфологии, посвященные технологии long-read секвенирования, а также доклады о разработке новых программ для упрощения и повышения эффективности интерпретации данных секвенирования.

Я, Александра Николаева, научный сотрудник Лаборатории эпигенетики ожирения и диабета, принимала участие в международной научной конференции «The European Society of Human Genetics». Презентовала постерный доклад на тему «Rare variants in the LEPR gene in three patients with severe early-onset obesity and hyperphagia identified in the Russian Federation». В рамках мероприятия сотрудники центра ознакомились с новыми продуктами и технологиями, предлагаемыми профильными компаниями, а также с докладами, способствующими расширению понимания интерпретации данных секвенирования нового поколения. Состоялось знакомство и обмен научными идеями с коллегами, представлявшими постерные доклады. В частности, была установлена научная коммуникация с профессором Тбилисского государственного медицинского университета Экой Кварацхели, в ходе которой обсуждались перспективы исследования глобального уровня метилирования у пациентов с муковисцидозом, а также возможности дальнейшего научного сотрудничества, направленного на изучение метилирования как потенциального биомаркера, предсказывающего развитие ожирения после терапии муковисцидоза. По итогам встречи было получено приглашение принять участие в курсе «Translational Epigenetics in Precision Medicine», который планируется провести 18-21 октября в городе Телави, Грузия.

Я, Анна Ефремова, научный сотрудник лаборатории эпигенетики, представила постерный доклад на тему «Reduced episignature of Sotos syndrome», во второй день конференции, 25 мая.

Коллеги из разных стран проявляли интерес к теме редуцированных эписигнатур и просили пояснить некоторые аспекты работы, такие как формула расчета уровня метилирования ДНК при бисульфитном секвенировании по Сенгеру. В нашей секции также представлял постерный доклад японский ученый Наомичи Мацумото. Он занимается аналогичным исследованием однолокусной эписигнатуры синдрома Сотоса, полученной с помощью секвенирования длинными ридами. Мы обсудили работы друг друга, и предложили поддерживать контакты для сотрудничества и взаимопомощи.

На третий день конференции, 26 мая, мы посетили воркшоп «Episignatures: utility and challenges», в котором принимали участие канадские коллеги. Мы пообщались с Саной Чуфани. Ученый выразила свое ожидание появления критерия, посвященного эписигнатурам, в одном из следующих обновлений гайдлайна по интерпретации данных NGS ACMG/AMP.

Доклады сотрудников Медико-генетического научного центра имени академика Н.П. Бочкова характеризуются актуальностью, перспективностью и практической значимостью. Они привлекли внимание ученых из других стран в области генетики и молекулярной биологии.

Гордимся сотрудниками центра и уверены, что их работа станет основой для новых прорывов в области генетики и персонализированной терапии!

Подробнее о конференции: https://2025.eshg.org/

Подробнее с докладами можно ознакомиться в Приложении:

Отдел функциональной геномики
Functional and clinical significance of splicing variants in patients with osteogenesis imperfecta	Стендовый доклад	Вяхирева Ю.В.
Functional analysis of splicing variants in patients with NBAS-associated phenotypes	Стендовый доклад	Акимова Д. Б.
Study of the splicing variants in the FBN1 gene of patient with Marfan syndrome	Стендовый доклад	Федотова Я.А.
New Insights into Variants in the NF1 and NF2 uORFs and Their Role in Neurofibromatosis Development	Стендовый доклад	Филатова А.Ю.
The clinical and molecular spectrum of Neurodegeneration with Brain Iron Accumulation in the largest national cohort	Стендовый доклад	Бараник Д.Н
Functional investigation of novel splice-affecting variants in the SCN9A gene in patients with Congenital Insensitivity to Pain	Стендовый доклад	Спарбер П.А.
An expanded view of uORF variants as causes of mendelian disorders	Стендовый доклад	Харитонов Д.В.
Лаборатория нейрогенетики
Investigating the clinical and genetic landscape of MORC2-related disorders	Постерный доклад	Муртазина А.Ф.
Integration sites and functional implications of novel processed pseudogenes	Постерный доклад	Боровиков А.О.
Comprehensive molecular characterization of eight families with FSHD2	Постерный доклад	Шерстюкова Д.В.
Лаборатория редактирования генома
CRISPR-based restoration of the reading frame in the DMD gene	Постерный доклад	Лавров А.В. (соавторы Olga A. Levchenko, Irina O. Panchuk, Konstantin S. Kochergin-Nikitsky, Olga V. Volodina, Sabina E. Nagieva, Elizaveta V. Kurshakova, Irina O. Petrova, Ekaterina V. Kondratyeva, Svetlana A. Smirnikhina, Alexander V. Lavrov).
PegRNA optimization for F508del correction: identifying key design features for AT-rich regions	Постерный доклад	Володина О.В. (соавторы Volodina O.V., Demchenko A.G., Anuchina A.A., Ryzhkova O.P., Kovalskaya V.A., Kondrateva E.V., Amelina E.L., Tabakov V.Y., Lavrov A.V., Smirnikhina S.A.).
Clinical heterogeneity of the GBE1 gene associated diseases	Постерный доклад	Нагиева С. (соавторы Sabina Nagieva, Natalia Semenova, Aysylu Murtazina, Viktoriia Zabnenkova, Victoria Bezverbnaya, Olga Shchagina, Andrey Zubovich, Zumrud Abdulmanapova, Natalia Taran, Tatyana Strokova, Ekaterina Zakharova).
Лаборатория эпигенетики
Mosaic form of the von Hippel-Lindau syndrome: case report	Постерный доклад	Михайленко Д.С.
Genotypes heterogeneity in PIK3CA-related overgrowth spectrum (PROS)	Постерный доклад	Бычкова Е.В.
Reduction of the number of CpG dinucleotides required for episignature analysis in CREBBP-related Rubinstein-Taybi syndrome	Постерный доклад	Земляная О.А.
Reduced episignature of Sotos syndrome	Постерный доклад	Ефремова А.В.
Лаборатория ДНК-диагностики
Поиск причин мышечной дистрофии Дюшенна/Беккера (МДД/МДБ) у российских пациентов без молекулярного диагноза с использованием полногеномного секвенирования (WGS)	Постерный доклад	Зинина Е.В.
Результаты полногеномного секвенирования (WGS) 106 российских пациентов с подозрением на наследственные заболевания сетчатки (НЗС)	Постерный доклад	Огородова Н.Ю.
Uniparental isodisomy as a mechanism of inheritance of autosomal recessive diseases".	Постерный доклад	Степанова А.А.
Лаборатория наследственных нарушений иммунитета
IGLL1 in Newborn Screening for Severe T and B Cell Lymphopenia Using TREC/KREC Detection	Постерный доклад	Амплеева М.А. (авторы — Maria Ampleeva, Andre Marakhonov, Anastasia Bobreshova, Efimova Irina, Anna Mukhina, Anna Shcherbina, Dmitry Pershin, Sergey Voronin, Sergey Kutsev)
Научно-клинический отдел
Presentation of a series of clinical cases of acromesomelic dysplasia, Maroteaux type, with a novel homozygous variant in the NPR2 gene	Постерный доклад	Маркова Т.В.
Expanding the phenotypic and genetic spectrum of PIEZO2-related distal artrogryposis type 5: a single center experience	Постерный доклад	Мельник Е.А.
Clinical and genetic characteristics of a patient with type III osteogenesis imperfecta caused by a novel pathogenic deletion in the last splicing site of the COL1A1 gene	Постерный доклад	Меркурьева Е.С.
Unveiling the phenotypic spectrum of spondyloepimetaphyseal dysplasia, Isidor-Toutain type associated with novel variants in the RPL13 gene	Постерный доклад	Городилова Д.В.
Novel Pathogenic Variant in the PDE4D Gene in a Case of Metaphyseal acroscyphodysplasia	Постерный доклад	Моргуль А.Р.
Molecular findings in children with intrahepatic cholestasis	Постерный доклад	Семенова Н.А.
Expanded clinical phenotype of RINT1: infantile-onset recurrent acute liverfailure and neutropenia	Постерный доклад	Нужная Е.Ю.
Comprehensive diagnostic approach to identifying pathogenic variants in SLC34A1 and SLC34A3 genes in patients with suspected NPT2 damag	Постерный доклад	Шарова М.В.
Лаборатория эпигенетики ожирения и диабета
Rare variants in the LEPR gene in three patients with severe early-onset obesity and hyperphagia identified in the Russian Federation	Постерный доклад	Николева А.Ф.
Центр коллективного пользования «Геном»
Challenges to the "reading-frame rule" in Duchenne and Becker muscular dystrophies: molecular insights from in-frame deletions and duplications E-Poster Presentation No.: EP12.065	Постерный доклад	Булах М.В.
A second case study: neurodevelopmental disorder linked to rare INTS8 gene mutation E-Poster Presentation No.: EP11.026	Постерный доклад	Забненкова В.В.
Novel ALAD gene variant and somatic mosaicism in the first Russian case of ALAD-deficiency porphyria E-Poster Presentation No.:EP15.040	Постерный доклад	Визеров Т.В.
X-chromosome inactivation patterns and clinical manifestations in Russian females with EDA mutations. Hybrid poster: P06.051.B	Постерный доклад	Ковальская В.А.
Identification of novel recurrent gross deletion in COL9A3 gene in Russian patients with multiple epiphyseal dysplasia. Hybrid poster: P06.053.D	Постерный доклад	Орлова М.Д.
Clinical Application of Whole Genome Sequencing in a Russian Cohort: Insights from 3600 Genomes. Hybrid poster: P15.092.C	Постерный доклад	Рыжкова О.П.
A novel homozygous splice-site variant int WDR4 results in rare microcephaly syndrome Hybrid poster: P15.176.C	Постерный доклад	Свиридов Ф.С.
The spectrum of rare variants of Noonan syndrome in a cohort of Russian patients E-Poster Presentation No.: EP15.112	Постерный доклад	Орлова А.А.
Genetic landscape of Kabuki syndrome in a Russian cohort: insights from KMT2D and KDM6A variants E-Poster Presentation No.: EP15.113	Постерный доклад	Забудская К.Г.
Лаборатория экспериментальной генной терапии болезней обмена веществ
X-ALD mutational spectrum in Russian patients and investigation of the ABCD1 gene splicing	Постерный доклад	Вытнова Н.А.
Background splicing of the GALNS gene unveils the hotspots for pathogenic splice-altering variants	Постерный доклад	Бычков И.О.
Expanding the Genetic and Clinical Spectrum of LBSL: Characterization of Russian Cohort of 206 Patients	Постерный доклад	Илюшкина А.А.
Mutational spectrum of Hypophosphatasia in Russian patients and investigation of the ALPL gene splicing	Постерный доклад	Мунов Д.М.
The Smpd1 Gene Mutational Spectrum Of 49 Patients with Niemann-Pick Disease In Russia	Постерный доклад	Василенко А.А.
Научно-клинический отдел муковисцидоза
Study of genetic heterogeneity of genetic variants of the CFTR gene in the Russian population	Постерный доклад	Мельяновская Ю.Л.