Получено Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ по автоматизированной оценке органоидов

Медико-генетический научный центр имени академика Н. П. Бочкова стал правообладателем Свидетельства о государственной регистрации программы автоматизированной оценки органоидов «OrganoMetric».

Программу разработали специалисты Медико-генетического научного центра имени академика Н. П. Бочкова: ведущий научный сотрудник лаборатории редактирования генома, к.б.н. Анна Григорьевна Демченко, научный сотрудник лаборатории мутагенеза Максим Витальевич Балясин и заведующая лабораторией редактирования генома, д.м.н. Светлана Анатольевна Смирнихина.

Программа «OrganoMetric» с использованием нейросетей позволяет в автоматическом режиме сканировать серию светлопольных изображений органоидов, полученных методом покадровой (time-lapse) микроскопии, и определять их морфометрические характеристики, такие как площадь, диаметр и форма.

 «Мы получаем изображения органоидов на автоматизированном микроскопе, а затем просто загружаем их в нашу программу. Она сама склеивает отдельные снимки в одно полное изображение, находит на нём каждый органоид и рассчитывает его характеристики – размер, форму и другие параметры. Раньше на это уходили часы работы вручную, а теперь программа делает всё за считаные минуты», – отметила Анна Григорьевна Демченко.

Программа обучена на изображениях органоидов респираторного тракта, однако ее можно применять для оценки 3D структур других органов.

Работа выполнена в рамках государственного задания Министерства науки и высшего образования Российской Федерации для МГНЦ по теме «Повышение эффективности коррекции мутаций при наследственных заболеваниях методами геномного редактирования».