Изучены спектры мутационных событий в локусе гена PAX6

Сотрудники лаборатории генетической эпидемиологии МГНЦ под руководством заведующей лаборатории, д.м.н., член-корр. РАН Зинченко Р.А. опубликовали статью в ведущем научном журнале International Journal of Molecular Sciences.

В статье проанализированы спектры мутационных событий в локусе гена PAX6, полученные в отдельных исследованиях, в том числе и при анализе собственной обширной выборки пациентов. Проведен сравнительных анализ данных генов с другими известными генами, ответственными за развитие заболеваний с аутосомно-доминантным типом наследования (с полной пенетрантностью и гаплонедостаточностью функции как основным патогенетическим механизмом). Кроме того, специалисты лаборатории сравнили спектр мутационных событий в локусе гена PAX6 со спектром de novo мутаций в геноме человека.

В результате исследования было обнаружено, что в российской когорте больных с врожденной аниридией (199 человек), как и в мировой популяции, выявлена высокая относительная частота хромосомных делеций и малых инделов, а также небольшая доля миссенс вариантов в гене PAX6.

При сравнении со спектрами мутационных событий в 20 других генах, ответственных за развитие доминантных заболеваний с полной пенетрантностью, оказалось, что локус гена PAX6 вписывается в установленный интервал, но по частоте инделов и крупных делеций по отношению к заменам находится у края спектра, напоминая пропорции для локусов генов VHL и APC.

Соотношение между однонуклеотидными заменами, инделами и крупными хромосомными событиями значимо отличается в спектрах, полученных для локусов генов, ассоциированных с доминантными заболеваниями и, в частности, для локуса PAX6 (1.5:0.8:1) и для de novo мутационных событий, происходящих в геноме человека (268.8:7.1:1).

Частота мутационных событий, приходящихся на «горячие точки», для локуса гена PAX6 составила 24% (48/199), что не согласуется с предполагавшимся ранее «минорным вкладом» мутаций в горячих точках в общий пул de novo мутационных событий.

Подробная информация представлена в опубликованной статье https://www.mdpi.com/1422-0067/23/12/6690