Москва, ул. Москворечье, д.1,
Медико-генетический научный центр
Контактная информация
Регистратура
+7 (495) 111-03-03
(многоканальный) 09:00 - 17:00
В ФГБНУ «МГНЦ» разработан метод широкогеномного анализа метилирования ДНК

В ФГБНУ «МГНЦ» разработан метод широкогеномного анализа метилирования ДНК

В ФГБНУ «МГНЦ» разработан метод широкогеномного анализа метилирования ДНК (публикация в журнале Epigenomics, импакт-фактор 4,541)

Сотрудники лаборатории эпигенетики ФГБНУ «МГНЦ» разработали метод широкогеномного анализа метилирования ДНК, применимый для тестирования значительных выборок образцов биологического материала. Новый способ бисульфитного секвенирования ограниченных выборок геномных локусов назван XmaI-RRBS. Его отличительной особенностью является эффективное сокращение размера библиотеки RRBS без значительной потери CpG-островков, основанное на использовании для подготовки библиотек эндонуклеазы XmaI. Одной из полезных технических находок, используемых при реализации XmaI-RRBS, является сайт-специфическое лигирование фрагментов геномных библиотек после частичной достройки липких концов, возникающих в результате действия рестриктазы XmaI (рисунок).

Tanas A.S., Borisova M.E., Kuznetsova E.B., Rudenko V.V., Karandasheva K.O., Nemtsova M.V., Izhevskaya V.L., Simonova O.A., Larin S.S., Zaletaev D.V., Strelnikov V.V. Rapid and affordable genome-wide bisulfite DNA sequencing by XmaI-reduced representation bisulfite sequencing // Epigenomics. – 2017. - Vol. 9, No. 6, P. 833-847.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28488887

Исследование поддержано грантом РФФИ 14–04–01606 A.



Москва, ул. Москворечье, д.1,
Медико-генетический научный центр
Контактная информация
Мы в социальных сетях
Регистратура
+7 (495) 111-03-03
(многоканальный) 09:00 - 17:00