Наш адрес:
Москва, ул. Москворечье, д.1,
Контактная информация
Регистратура с 9 до 17
+7 (495) 111-03-03
(многоканальный)
Лаборатория молекулярной биологии
Лаборатория молекулярной биологии



РУКОВОДИТЕЛЬ
Костюк Светлана Викторовна
заведующая лабораторией д.б.н.
svet-vk@yandex.ru
Подробнее
НАУЧНЫЙ ПЕРСОНАЛ:

Вейко Наталья Николаевна , главный научный сотрудник д.б.н. 

Ершова Елизавета Сергеевна,  ведущий научный сотрудник к.б.н.

Шмарина Галина Васильевна,  ведущий научный сотрудник к.м.н

Малиновская Елена Михайловна, ведущий научный сотрудник  к.б.н.

Конькова Марина Сергеевна, старший научный сотрудник  к.б.н.    

Мартынов Андрей Владимирович, старший научный сотрудник к.б.н.

Пороховник Лев Николаевич, научный сотрудник к.б.н.   

Каменева Лариса Владимировна, научный сотрудник      

Сергеева Василина Александровна,  научный сотрудник      

Долгих Ольга Адольфовна,  научный сотрудник    

Честков Илья Валерьевич, научный сотрудник             

Чудакова Юлия Михайловна,  научный сотрудник

Пухальская Дарья Александровна,  младший научный сотрудник      

Вейко Роман Владимирович, младший научный сотрудник

Кожина Екатерина Алексеевна, младший научный сотрудник

Кальянов Андрей Александрович, аспирант

Филев Антон Дмитриевич, аспирант

Орлова Мария Дмитриевна, лаборант-исследователь   

Савинова Екатерина Алексеевна, лаборант-исследователь

Абрамова Маргарита Сергеевна, лаборант-исследователь

Канонирова Серафима Александровна, лаборант-исследователь
КОНТАКТЫ

Тел 8 (499) 612-81-93

e-mail: svet-vk@yandex.ru.

Основные публикации

Основным направлением деятельности коллектива лаборатории молекулярной биологии является структурно-функциональный анализ генома человека на молекулярном, биохимическом и клеточном уровне.

Исследования ведутся по темам НИР:

I.     «Молекулярные механизмы действия фрагментов внеклеточной ДНК человека на функционирование различных клеток организма».

В настоящее время в лаборатории изучаются свойства внеклеточной ДНК в норме, при различных заболеваниях (аутоиммунных, воспалительных, нейродегенеративных, психиатрических), при критических состояниях, при стрессе и при беременности. Показано, что при патологии значительно изменяются такие свойства внеклеточной ДНК, как концентрация в плазме крови, размеры фрагментов, содержание GC-богатых последовательностей, уровень окислительной модификации оснований.

Исследуется также биологическая активность внеклеточной ДНК. Моделирование in vitro процессов, происходящих при действии внеклеточной ДНК, позволяет исследовать изменение активности генов при патологии и выявить клеточные сигнальные пути, задействованные в развитии патологии. Показано, что в результате воздействия внеклеточной ДНК изменяется профиль экспрессии генов сигнальных путей, отвечающих за репарацию ДНК, адаптивный ответ и антиоксидантную активность в клетках.

Сотрудниками лаборатории был обнаружен молекулярный механизм, посредством которого клеточная популяция (или организм) отвечает на окислительный стресс. Основным «игроком» в изучаемом сигнальном каскаде является окисленная и/или CpG-обогащенная внеклеточная ДНК. Внеклеточная ДНК обладает способностью проникать в структуры клетки, сближенные с ядерной мембраной, и вызывать увеличение синтеза активных форм кислорода (АФК) в митохондриях. «Взрыв» синтеза АФК вблизи ядра вызывает окисление и образование разрывов ДНК ядер, а также развитие в клеточной популяции адаптивного ответа, направленного на выживание клеток, в том числе, и клеток с поврежденной ДНК. Этот процесс может приводить к перестройкам генома и к возникновению новых генетических вариантов. В настоящее время продолжаются исследования молекулярного механизма взаимодействия внеклеточной ДНК с клетками разного типа, проводится поиск рецепторов, через которые внеклеточная ДНК действует на клетки.

II. «Исследование влияния наноматериалов на функциональную активность генома клеток человека».

Коллектив лаборатории проводит исследование влияния новых водорастворимых производных фуллерена [C60] и/или [C70] на функциональную активность генома клеток человека. Впервые описан механизм антиоксидантной активности фуллеренов: показано, что фуллерены, которые активно ингибируют активные формы кислорода, тем не менее, индуцируют в клетках человека окислительный стресс. Показано, что фуллерены могут изменять направление дифференцировки стволовых клеток.

В лаборатории молекулярной биологии в настоящее время проводятся исследования, поддержанные грантами РФФИ:

1.                «Внеклеточная ДНК как сигнальная молекула при действии малых доз радиации. Исследование молекулярного механизма действия малых доз радиации на стволовые клетки человека - адаптивный ответ или повреждение ДНК ядер клеток?» (16-04-01099)

Проект направлен на исследование молекулярных механизмов действия малых доз радиации на стволовые клетки человека. При выполнении проекта планируется обосновать гипотезу о действии малых доз радиации через внеклеточный медиатор передачи сигнала между клетками – фрагменты ГЦ-обогащенной окисленной внеклеточной ДНК.

2.                «Исследование роли внеклеточной ДНК и нарушений транскриптома сигнальных путей в патогенезе шизофрении» (17-29-06017)

Проект направлен на исследование свойств циркулирующей вкДНК больных шизофренией и на выяснение роли циркулирующей внеклеточной ДНК в изменении профиля транскрипционной активности генома клеток больных шизофренией.

3.                «Нарушения транскриптома сигнальных каскадов при аутизме. Исследование роли внеклеточной ДНК в патогенезе аутизма» (17-04-01587)

Проект направлен на выявление клеточных сигнальных каскадов, задействованных в развитии аутизма. При выполнении проекта планируется исследовать роль внеклеточной ДНК в прогрессии аутизма, выявить потенциальные гены-мишени сигнальных путей, задействованные в ответе клеток больных аутизмом на окислительный стресс, инициированный фрагментами вкДНК.

4.     «Анализ роли митохондрий в регуляции процесса апоптоза при действии ионизирующего излучения в малых и средних дозах» (18-34-00878)

Проект направлен на анализ роли митохондрий в регуляции процесса апоптоза при действии ионизирующего излучения в малых и средних дозах и исследование молекулярных механизмов, приводящих к развитию адаптивного ответа.

В 2018 году сотрудниками лаборатории молекулярной биологии получен грант РНФ «Роль рибосомных генов в этиологии и патогенезе шизофрении. Прогностическое значение свойств комплекса рибосомных генов больного в ответе на терапию шизофрении» (18-15-00437)

При выполнении проекта будет исследована структурно-функциональная организация рибосомных генов (рДНК) больных шизофренией в сравнении с рибосомными генами психически здоровых людей: определены вариабельность общего количества копий рДНК в геномах, уровни метилирования различных участков рДНК, повреждения рДНК, экспрессии генов рРНК (количество рРНК). Свойства комплекса рибосомных генов будут сопоставлены с клиническими формами шизофрении, с эффективностью ответа организма больного на терапию. Для характеристики общих свойств генома клеток больных шизофренией будет исследована вариабельность трех повторов – митохондриальной ДНК (маркер количества митохондрий), теломерного повтора (маркер уровня окислительного стресса и старения) и сателлита III(1q12) (оценка нестабильности генома). На первичных клетках и на культурах клеток больных и здоровых людей, на нейронах мозга крысы будет исследовано действие ряда применяемых в отечественной психиатрии антипсихотических средств на свойства комплекса рибосомных генов и на вариабельность трех других перечисленных повторов генома. Будет исследована возможность снижения активности транскрипции рибосомных генов в клетках больных с применением новых отечественных соединений, которые вызывают избирательное метилирование рибосомной ДНК.

В лаборатории молекулярной биологии ведутся исследования по проекту, поддержанному Программой научных исследований президиума РАН «Фундаментальные исследования для биомедицинских технологий» на 2018 – 2020 гг. «Исследование роли ГЦ-богатых последовательностей внеклеточной ДНК в межклеточных взаимодействиях при развитии адаптивного ответа раковых клеток; создание средств воздействия на межклеточные взаимодействия при терапии онкологических заболеваний».

В проекте будет проведено исследование возможности снижения толерантности у клеток злокачественных опухолей к применяемой терапии с помощью геномного редактирования и малых интерферирующих РНК.